几何形态测量应用培训(含三维形态分析)-2023年11月4-5日-线上直播
【课程介绍】几何形态测量学(Geometric morphometrics, GM)自20世纪80年创立之初,即打破了传统形态测量学(Traditional morphometrics, TM)的多种缺陷,被誉为“形态测量学的革命”。该方法的最大优势在于,能够很好地保留物体本身的几何信息(Geometry information),而不仅仅是度量信息(measurement information),并配合使用复杂的统计学计算对生物形态进行分析,能够最大程度地利用图像分析生物体形态的变化和变异情况,即使非常微小的差异也能够发掘。目前该方法已经广泛应用到生物、考古、医学、动植物分类鉴定等各个领域的研究中,成为主流的研究手段。
课程通过对几何形态测量方法的讲解,可以让学员了解几何形态测量的发展历史,主要应用方法,R语言的实现,包括结果解读与制图在内的分析,并结合实际研究案例进行深入浅出的讲解,力求在短期内最大限度提升学员对二维和三维研究对象的应用分析能力。
【培训对象】本课程面向广大科研工作者、博士后、研究生等对提升生物体形态数据分析技能有迫切需求的群体。
【培训目标】为期两天的学习,通过对研究样本的二维和三维重建和可视化,使学员更全面地了解GM基础知识,轻松掌握数据准备、数据分析、图表可视化、结果解读等。
【培训特色】本次课程以GM分析为主线,逐一详细剖析,全程电脑实战操作练习。无繁琐的理论授课,学员跟着老师,根据案例,一步一步进行电脑实操,做到课程学完,就能独立进行GM分析的各个步骤,应用相关软件,自己完成GM分析。
【讲师简介】方博士,主要从事水生生物学方面的研究。对几何形态测量法有着较为深入的研究,目前已经在《Hydrobiologia》、《Fisheries Research》、《Bulletin of Marine Science》、《Frontiers in Marine Science》等著名期刊发表论文50余篇,获授权国家专利4项,参编著作5部,获省部级科技奖项6项等。
【培训时间】2023年11月4-5日(周六、周日)
【培训方式】在线直播+提供PPT、案例 +课后在线答疑
【培训费用】1600元/人,包含培训费、资料费等。
【课程大纲】
时间 |
安排 |
D1 |
|
9:00-10:00 |
几何形态测量学的介绍 |
10:00-11:00 |
数据的准备(二维、三维图像采集、形态数据提取) |
11:00-12:00 |
基于R语言的统计分析1(广义普式分析、普式方差分析、主成分分析) |
12:00-14:00 |
休息 |
14:00-15:00 |
基于R语言的统计分析2(多元回归分析、判别分析、系统聚类分析) |
15:00-16:00 |
基于R语言的几何形态测量学分析(轮廓线法) |
16:00-16:50 |
基于R语言的数据可视化 |
17:00-17:30 |
讨论答疑 |
D2 |
|
9:00-10:00 |
基于MorphoJ软件的几何形态测量学分析 |
10:00-11:00 |
案例分析1:基于地标点法的海洋生物形态分析 |
11:00-12:00 |
案例分析2:基于轮廓线法的海洋生物形态分析 |
12:00-14:00 |
休息 |
14:00-15:00 |
基于几何形态测量学的生物形态系统发育分析 |
15:00-16:00 |
基于几何形态测量学的生物生态形态学分析 |
16:00-17:00 |
几何形态测量学的分类鉴定流程 |
17:00-17:30 |
讨论答疑 |
为R语言零基础学员,免费提供《R语言入门》视频
【部分案例展示】
地标点示意图
主成分散点图和薄板样条变形网格
系统(层次)聚类图
系统(层次)聚类热图
【主办单位】北京凌云翼数据科技有限公司
【报名方式】登陆以下网址或扫描二维码,填写“凌云翼培训在线报名表2023年”
https://www.wjx.top/vm/rxk9RCe.aspx#
在线提交报名后,会务组将于提前2周将盖章版的培训/会议通知、缴费方式、注意事项等发送到报名时提交的邮箱,请收到邮件正式通知后,安排缴费事宜。
我们会提前启动课前预习,并组建QQ群,帮助学员调试软件,学员可自行安排预习时间。为了达到更好的效果,希望大家提早报名。
【缴费方式】注册费可通过银行对公账户汇款、支付宝、微信扫码3种方式缴付(可公务卡、信用卡支付),付款均进入主办方的对公账户。培训提供正规发票(可开培训费或会议费,电子版发票或纸版发票均可)及相应通知。会务组提前2周将正式的培训通知及具体缴费方式发送到报名时提交的邮箱,学员可根据上面的指导进行缴费。
【会务联系人】黄老师, Tel: 010-82748950 / 139 1082 2427(微信同号),QQ:3405105887,邮箱:info@bjupclouddata.com
【其他事宜】
1、 发票事宜:提供正规发票,可以开电子发票或纸制发票,开票内容一般为“培训费”或“会议费”,并提供相应的培训通知或会议通知,在线报名时请注明开票内容,并选择电子或纸制发票即可。电子版培训通知一般提前2周以电子邮件的形式提供,发票(电子发票或纸制发票)一般将于直播结束后5个工作日内发送到学员提供的邮箱或快递。如需提前索要发票,请与会务组黄老师联系。
2、培训流程
3、培训证书
参加培训的学员可获得相关专业技能培训证书
4、录播课程
如果您错过了直播课时间,没关系,我们还有录播课,欢迎关注。
录播课程查看方式:微信关注“凌云翼”公众号,进入公众号,底部点击“唯真课堂”,即可查找相关课程
5、其它未尽事宜可随时联系会务组。
时间 |
安排 |
D1 |
|
9:30-10:30 |
几何形态测量学的介绍 |
10:30-11:30 |
图像数据的采集流程 |
14:30-15:30 |
形态数据的提取(地标点、半地标点、轮廓线) |
15:30-16:30 |
基于MorphoJ软件的几何形态测量学分析(地标点法与轮廓线法) |
16:30-17:00 |
讨论答疑 |
D2 |
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9:30-10:30 |
基于R语言的几何形态测量学分析(地标点法与轮廓线法) |
10:30-11:30 |
几何形态测量学的分类鉴定流程 |
14:30-15:30 |
基于几何形态测量学的生物形态系统发育分析 |
15:30-16:30 |
基于几何形态测量学的生物生态形态学分析 |
16:30-17:00 |
讨论答疑 |